Protein–RNA interactions for Protein: A0A1L1SR87

1810010D01Rik, RIKEN cDNA 1810010D01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810010D01RikA0A1L1SR87 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
1810010D01RikA0A1L1SR87 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1810010D01RikA0A1L1SR87 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
1810010D01RikA0A1L1SR87 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
1810010D01RikA0A1L1SR87 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1810010D01RikA0A1L1SR87 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1810010D01RikA0A1L1SR87 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1810010D01RikA0A1L1SR87 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1810010D01RikA0A1L1SR87 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1810010D01RikA0A1L1SR87 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
1810010D01RikA0A1L1SR87 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
1810010D01RikA0A1L1SR87 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1810010D01RikA0A1L1SR87 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
1810010D01RikA0A1L1SR87 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
1810010D01RikA0A1L1SR87 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
1810010D01RikA0A1L1SR87 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
1810010D01RikA0A1L1SR87 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
1810010D01RikA0A1L1SR87 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
1810010D01RikA0A1L1SR87 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1810010D01RikA0A1L1SR87 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1810010D01RikA0A1L1SR87 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
1810010D01RikA0A1L1SR87 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1810010D01RikA0A1L1SR87 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1810010D01RikA0A1L1SR87 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
1810010D01RikA0A1L1SR87 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1810010D01RikA0A1L1SR87 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
1810010D01RikA0A1L1SR87 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1810010D01RikA0A1L1SR87 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
1810010D01RikA0A1L1SR87 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
1810010D01RikA0A1L1SR87 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
1810010D01RikA0A1L1SR87 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
1810010D01RikA0A1L1SR87 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
1810010D01RikA0A1L1SR87 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
1810010D01RikA0A1L1SR87 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
1810010D01RikA0A1L1SR87 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
1810010D01RikA0A1L1SR87 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1810010D01RikA0A1L1SR87 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1810010D01RikA0A1L1SR87 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
1810010D01RikA0A1L1SR87 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1810010D01RikA0A1L1SR87 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
1810010D01RikA0A1L1SR87 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1810010D01RikA0A1L1SR87 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1810010D01RikA0A1L1SR87 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
1810010D01RikA0A1L1SR87 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
1810010D01RikA0A1L1SR87 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1810010D01RikA0A1L1SR87 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1810010D01RikA0A1L1SR87 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1810010D01RikA0A1L1SR87 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
1810010D01RikA0A1L1SR87 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
1810010D01RikA0A1L1SR87 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
1810010D01RikA0A1L1SR87 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
1810010D01RikA0A1L1SR87 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
1810010D01RikA0A1L1SR87 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1810010D01RikA0A1L1SR87 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
1810010D01RikA0A1L1SR87 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
1810010D01RikA0A1L1SR87 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1810010D01RikA0A1L1SR87 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
1810010D01RikA0A1L1SR87 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
1810010D01RikA0A1L1SR87 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1810010D01RikA0A1L1SR87 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1810010D01RikA0A1L1SR87 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1810010D01RikA0A1L1SR87 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
1810010D01RikA0A1L1SR87 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1810010D01RikA0A1L1SR87 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1810010D01RikA0A1L1SR87 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1810010D01RikA0A1L1SR87 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1810010D01RikA0A1L1SR87 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
1810010D01RikA0A1L1SR87 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1810010D01RikA0A1L1SR87 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
1810010D01RikA0A1L1SR87 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1810010D01RikA0A1L1SR87 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1810010D01RikA0A1L1SR87 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1810010D01RikA0A1L1SR87 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1810010D01RikA0A1L1SR87 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1810010D01RikA0A1L1SR87 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1810010D01RikA0A1L1SR87 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
1810010D01RikA0A1L1SR87 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1810010D01RikA0A1L1SR87 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1810010D01RikA0A1L1SR87 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
1810010D01RikA0A1L1SR87 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
1810010D01RikA0A1L1SR87 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1810010D01RikA0A1L1SR87 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1810010D01RikA0A1L1SR87 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1810010D01RikA0A1L1SR87 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1810010D01RikA0A1L1SR87 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1810010D01RikA0A1L1SR87 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1810010D01RikA0A1L1SR87 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1810010D01RikA0A1L1SR87 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1810010D01RikA0A1L1SR87 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
1810010D01RikA0A1L1SR87 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1810010D01RikA0A1L1SR87 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
1810010D01RikA0A1L1SR87 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
1810010D01RikA0A1L1SR87 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1810010D01RikA0A1L1SR87 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1810010D01RikA0A1L1SR87 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
1810010D01RikA0A1L1SR87 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
1810010D01RikA0A1L1SR87 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
1810010D01RikA0A1L1SR87 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
1810010D01RikA0A1L1SR87 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
1810010D01RikA0A1L1SR87 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms