Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15□□□□□ -0.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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