Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K3

B230359F08Rik, RIKEN cDNA B230359F08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230359F08RikA0A0B4J1K3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
B230359F08RikA0A0B4J1K3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
B230359F08RikA0A0B4J1K3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B230359F08RikA0A0B4J1K3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
B230359F08RikA0A0B4J1K3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B230359F08RikA0A0B4J1K3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms