Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sumo3Q9Z172 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms