Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hmg20bQ9Z104 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hmg20bQ9Z104 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms