Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S5

Cldn15, Claudin-15, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn15Q9Z0S5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Cldn15Q9Z0S5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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Cldn15Q9Z0S5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Cldn15Q9Z0S5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Cldn15Q9Z0S5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Cldn15Q9Z0S5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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Cldn15Q9Z0S5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Cldn15Q9Z0S5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cldn15Q9Z0S5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn15Q9Z0S5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn15Q9Z0S5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn15Q9Z0S5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn15Q9Z0S5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn15Q9Z0S5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn15Q9Z0S5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn15Q9Z0S5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn15Q9Z0S5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn15Q9Z0S5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn15Q9Z0S5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cldn15Q9Z0S5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn15Q9Z0S5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn15Q9Z0S5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn15Q9Z0S5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn15Q9Z0S5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn15Q9Z0S5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cldn15Q9Z0S5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms