Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AireQ9Z0E3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AireQ9Z0E3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms