Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnip1Q9WUU8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnip1Q9WUU8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnip1Q9WUU8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms