Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb3Q9R1P1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb3Q9R1P1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms