Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cry2Q9R194 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cry2Q9R194 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms