Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vav3Q9R0C8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Vav3Q9R0C8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vav3Q9R0C8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms