Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Copg1Q9QZE5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Copg1Q9QZE5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms