Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ChmQ9QXG2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChmQ9QXG2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms