Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clca3a1Q9QX15 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clca3a1Q9QX15 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms