Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PdcQ9QW08 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdcQ9QW08 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms