Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CHPF2Q9P2E5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHPF2Q9P2E5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms