Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMPD4Q9NXE4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMPD4Q9NXE4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms