Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cul3Q9JLV5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cul3Q9JLV5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms