Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irx5Q9JKQ4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Irx5Q9JKQ4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irx5Q9JKQ4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms