Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmod2Q9JKK7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmod2Q9JKK7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms