Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cnga3Q9JJZ8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cnga3Q9JJZ8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms