Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ4

Ube2j1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2j1Q9JJZ4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2j1Q9JJZ4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2j1Q9JJZ4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2j1Q9JJZ4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2j1Q9JJZ4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2j1Q9JJZ4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2j1Q9JJZ4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2j1Q9JJZ4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2j1Q9JJZ4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2j1Q9JJZ4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2j1Q9JJZ4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2j1Q9JJZ4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2j1Q9JJZ4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2j1Q9JJZ4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2j1Q9JJZ4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2j1Q9JJZ4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2j1Q9JJZ4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2j1Q9JJZ4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2j1Q9JJZ4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2j1Q9JJZ4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2j1Q9JJZ4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2j1Q9JJZ4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2j1Q9JJZ4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2j1Q9JJZ4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2j1Q9JJZ4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms