Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR9

Nrip3, Nuclear receptor-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip3Q9JJR9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nrip3Q9JJR9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nrip3Q9JJR9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms