Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJA4

Wdr12, Ribosome biogenesis protein WDR12, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr12Q9JJA4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Wdr12Q9JJA4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Wdr12Q9JJA4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Wdr12Q9JJA4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Wdr12Q9JJA4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Wdr12Q9JJA4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Wdr12Q9JJA4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Wdr12Q9JJA4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Wdr12Q9JJA4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr12Q9JJA4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr12Q9JJA4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr12Q9JJA4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr12Q9JJA4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr12Q9JJA4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr12Q9JJA4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr12Q9JJA4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr12Q9JJA4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr12Q9JJA4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr12Q9JJA4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr12Q9JJA4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr12Q9JJA4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr12Q9JJA4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr12Q9JJA4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr12Q9JJA4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr12Q9JJA4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr12Q9JJA4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr12Q9JJA4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr12Q9JJA4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr12Q9JJA4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr12Q9JJA4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr12Q9JJA4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr12Q9JJA4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr12Q9JJA4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr12Q9JJA4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr12Q9JJA4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr12Q9JJA4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr12Q9JJA4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr12Q9JJA4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms