Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Brd4Q9ESU6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Brd4Q9ESU6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Brd4Q9ESU6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Brd4Q9ESU6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Brd4Q9ESU6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Brd4Q9ESU6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Brd4Q9ESU6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Brd4Q9ESU6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Brd4Q9ESU6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Brd4Q9ESU6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Brd4Q9ESU6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Brd4Q9ESU6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Brd4Q9ESU6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Brd4Q9ESU6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Brd4Q9ESU6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Brd4Q9ESU6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Brd4Q9ESU6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Brd4Q9ESU6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Brd4Q9ESU6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Brd4Q9ESU6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Brd4Q9ESU6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Brd4Q9ESU6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Brd4Q9ESU6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Brd4Q9ESU6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Brd4Q9ESU6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Brd4Q9ESU6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Brd4Q9ESU6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Brd4Q9ESU6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Brd4Q9ESU6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Brd4Q9ESU6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Brd4Q9ESU6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Brd4Q9ESU6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Brd4Q9ESU6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Brd4Q9ESU6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Brd4Q9ESU6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Brd4Q9ESU6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Brd4Q9ESU6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Brd4Q9ESU6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Brd4Q9ESU6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Brd4Q9ESU6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Brd4Q9ESU6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Brd4Q9ESU6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Brd4Q9ESU6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Brd4Q9ESU6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Brd4Q9ESU6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Brd4Q9ESU6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Brd4Q9ESU6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Brd4Q9ESU6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Brd4Q9ESU6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Brd4Q9ESU6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Brd4Q9ESU6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Brd4Q9ESU6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Brd4Q9ESU6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Brd4Q9ESU6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Brd4Q9ESU6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Brd4Q9ESU6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms