Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ropn1Q9ESG2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ropn1Q9ESG2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms