Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cse1lQ9ERK4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cse1lQ9ERK4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cse1lQ9ERK4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cse1lQ9ERK4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cse1lQ9ERK4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cse1lQ9ERK4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cse1lQ9ERK4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cse1lQ9ERK4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cse1lQ9ERK4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cse1lQ9ERK4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cse1lQ9ERK4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cse1lQ9ERK4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cse1lQ9ERK4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cse1lQ9ERK4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cse1lQ9ERK4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cse1lQ9ERK4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cse1lQ9ERK4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cse1lQ9ERK4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cse1lQ9ERK4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cse1lQ9ERK4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cse1lQ9ERK4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cse1lQ9ERK4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cse1lQ9ERK4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cse1lQ9ERK4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cse1lQ9ERK4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cse1lQ9ERK4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cse1lQ9ERK4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cse1lQ9ERK4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cse1lQ9ERK4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cse1lQ9ERK4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cse1lQ9ERK4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cse1lQ9ERK4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cse1lQ9ERK4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cse1lQ9ERK4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cse1lQ9ERK4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cse1lQ9ERK4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms