Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR1

Cmtm2a, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2aQ9DAR1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cmtm2aQ9DAR1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm2aQ9DAR1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms