Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem239Q9DA47 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem239Q9DA47 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms