Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tvp23bQ9D8T4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tvp23bQ9D8T4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tvp23bQ9D8T4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms