Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin37Q9D8N6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin37Q9D8N6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin37Q9D8N6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin37Q9D8N6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin37Q9D8N6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin37Q9D8N6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lin37Q9D8N6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin37Q9D8N6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin37Q9D8N6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin37Q9D8N6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin37Q9D8N6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin37Q9D8N6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin37Q9D8N6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin37Q9D8N6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin37Q9D8N6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin37Q9D8N6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin37Q9D8N6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin37Q9D8N6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin37Q9D8N6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin37Q9D8N6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin37Q9D8N6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lin37Q9D8N6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lin37Q9D8N6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lin37Q9D8N6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lin37Q9D8N6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms