Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G3

2900055J20Rik, RIKEN cDNA 2900055J20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2900055J20RikQ9D6G3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
2900055J20RikQ9D6G3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
2900055J20RikQ9D6G3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
2900055J20RikQ9D6G3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
2900055J20RikQ9D6G3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
2900055J20RikQ9D6G3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
2900055J20RikQ9D6G3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
2900055J20RikQ9D6G3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2900055J20RikQ9D6G3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2900055J20RikQ9D6G3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2900055J20RikQ9D6G3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
2900055J20RikQ9D6G3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms