Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V6

Tomm20l, TOMM20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20lQ9D4V6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tomm20lQ9D4V6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tomm20lQ9D4V6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tomm20lQ9D4V6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tomm20lQ9D4V6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tomm20lQ9D4V6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tomm20lQ9D4V6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tomm20lQ9D4V6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tomm20lQ9D4V6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tomm20lQ9D4V6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tomm20lQ9D4V6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tomm20lQ9D4V6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tomm20lQ9D4V6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tomm20lQ9D4V6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tomm20lQ9D4V6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tomm20lQ9D4V6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tomm20lQ9D4V6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tomm20lQ9D4V6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tomm20lQ9D4V6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tomm20lQ9D4V6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tomm20lQ9D4V6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tomm20lQ9D4V6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tomm20lQ9D4V6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tomm20lQ9D4V6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tomm20lQ9D4V6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tomm20lQ9D4V6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms