Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clvs1Q9D4C9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Clvs1Q9D4C9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Clvs1Q9D4C9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms