Protein–RNA interactions for Protein: Q9D420

4933421I07Rik, RIKEN cDNA 4933421I07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933421I07RikQ9D420 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933421I07RikQ9D420 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933421I07RikQ9D420 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933421I07RikQ9D420 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933421I07RikQ9D420 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
4933421I07RikQ9D420 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933421I07RikQ9D420 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933421I07RikQ9D420 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933421I07RikQ9D420 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4933421I07RikQ9D420 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
4933421I07RikQ9D420 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933421I07RikQ9D420 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
4933421I07RikQ9D420 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933421I07RikQ9D420 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933421I07RikQ9D420 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933421I07RikQ9D420 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933421I07RikQ9D420 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
4933421I07RikQ9D420 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933421I07RikQ9D420 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933421I07RikQ9D420 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933421I07RikQ9D420 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933421I07RikQ9D420 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933421I07RikQ9D420 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933421I07RikQ9D420 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4933421I07RikQ9D420 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933421I07RikQ9D420 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933421I07RikQ9D420 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933421I07RikQ9D420 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933421I07RikQ9D420 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933421I07RikQ9D420 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
4933421I07RikQ9D420 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933421I07RikQ9D420 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933421I07RikQ9D420 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4933421I07RikQ9D420 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4933421I07RikQ9D420 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms