Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3F6

Ms4a4c, MCG12897, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4cQ9D3F6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ms4a4cQ9D3F6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ms4a4cQ9D3F6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms