Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rufy3Q9D394 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rufy3Q9D394 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms