Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fndc8Q9D2H8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fndc8Q9D2H8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc8Q9D2H8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms