Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Necap2Q9D1J1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Necap2Q9D1J1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms