Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXY1

Tmem175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem175Q9CXY1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem175Q9CXY1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem175Q9CXY1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem175Q9CXY1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem175Q9CXY1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem175Q9CXY1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem175Q9CXY1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem175Q9CXY1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem175Q9CXY1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem175Q9CXY1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem175Q9CXY1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem175Q9CXY1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem175Q9CXY1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem175Q9CXY1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem175Q9CXY1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem175Q9CXY1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem175Q9CXY1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem175Q9CXY1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem175Q9CXY1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem175Q9CXY1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem175Q9CXY1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem175Q9CXY1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem175Q9CXY1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem175Q9CXY1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem175Q9CXY1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem175Q9CXY1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem175Q9CXY1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem175Q9CXY1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem175Q9CXY1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem175Q9CXY1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem175Q9CXY1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem175Q9CXY1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem175Q9CXY1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem175Q9CXY1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem175Q9CXY1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem175Q9CXY1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms