Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhfpl3Q9CTN8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms