Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5sQ9CRA7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5sQ9CRA7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms