Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim8Q9CQQ0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms