Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chchd5Q9CQP3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Chchd5Q9CQP3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Chchd5Q9CQP3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chchd5Q9CQP3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Chchd5Q9CQP3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chchd5Q9CQP3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chchd5Q9CQP3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chchd5Q9CQP3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Chchd5Q9CQP3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chchd5Q9CQP3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chchd5Q9CQP3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chchd5Q9CQP3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chchd5Q9CQP3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chchd5Q9CQP3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chchd5Q9CQP3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chchd5Q9CQP3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chchd5Q9CQP3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chchd5Q9CQP3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chchd5Q9CQP3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Chchd5Q9CQP3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chchd5Q9CQP3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chchd5Q9CQP3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chchd5Q9CQP3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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