Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pdzk1ip1Q9CQH0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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