Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl49Q9CQ40 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mrpl49Q9CQ40 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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