Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PUS3Q9BZE2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PUS3Q9BZE2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms