Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Scd3Q99PL7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scd3Q99PL7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms