Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab27bQ99P58 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab27bQ99P58 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms