Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp16Q99LG0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Usp16Q99LG0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms